自新一轮援疆工作实施以来，杭州援疆基本参照了援川模式。目前，援疆项目主要分为交钥匙工程和交支票工程，其中交钥匙工程为全部采用援疆资金且由杭州市审计局负责审计，交支票工程由当地政府部门为项目主体组织实施，以当地监管为主，并由当地审计部门或指挥部内审领导小组审计。三年来，指挥部投入援疆资金3.65亿元帮助阿克苏市实施了安居富民工程、智力援助、产业援疆、平安工程、文化交流等43个交支票项目，为改善当地民生，促进阿克苏的社会稳定和长治久安做出了贡献。“交支票不交责任”是援疆工作的要求，但如何做到交支票不交责任是个难题。从以往兄弟单位援疆实践分析，曾发生过交支票工程的援疆资金已拨付到位，但因施工企业挪用资金，拖欠材料款和民工工资造成上访，加上援疆批次时间的限定，上访人员越级到地区和省级指挥部群访，由此影响了项目建设进度，严重损害了援疆声誉，为此，杭州市第八批援疆指挥部根据实际创新制度，运用新型监管方式，补齐了监管中的短板，取得了初步成效。
一是实行援疆资金“四重监督”制度，落实监管责任。“四重监督”制度是指在援疆项目资金审核拨付上，建立由建设单位现场监督、阿克苏市援阿办复核监督、杭州市援疆指挥部重点监督和阿克苏市财政局辅助监督等4层监管体系，明确各部门岗位职责，通过对项目资金层层复核，道道把关，确保资金合理规范使用。具体程序是：项目建设单位根据进度提出资金申请，市援阿办根据《援疆项目资金管理办法》进行初审，指挥部到项目现场进行抽查核实后，将资金拨付到市财政局，市财政局根据施工合同相关条款支付到施工单位。项目竣工验收后，由当地审计部门对项目实施的程序性、规范性、工程造价、资金拨付等进行全方位审计，指挥部根据审计报告及时足额拨付到位。根据援疆工作批次划分和时间限定的特点，为防止工程款被项目施工单位挪用或滞拨，或因拖欠款项造成群体上访等影响援疆声誉事件的发生，指挥部与杭州联合银行协商，创新建立资金“共同监管账户”制度。“共同监管账户”由指挥部、项目施工单位和遴选确定的开户银行等3家单位共同协商开设，明确项目进度款经审核后，指挥部先将资金拨付到该监管账户，项目施工单位在具体使用资金时，须事先向指挥部提供民工工资支付清单或本项目材料供货合同，经确认后，银行部门依据确认文件办理资金转账和支付手续，确保了项目建设资金的定向使用。该制度为杭州市援疆指挥部在全省援疆系统中首创，实施至今未发生一起民工上访事件和建设资金被挤占挪用现象，确保援疆资金的及时定向使用，保证了援疆项目的顺利推进。
二是实行援疆资金联合检查跟踪制度，注重过程监督。
交支票工程作为援疆项目重要组成部分，在阿克苏市纪委监督下，在尊重受援地主体地位，发挥项目受援单位主体作用的同时，指挥部加强对资金使用的过程监管。指挥部将援疆资金拨付至阿克苏市财政局专户后继续跟踪监管，联合当地审计局、财政局定期对援疆资金的拨付进度、使用范围开展专项核查工作，防止出现援疆资金被挤占、挪用、截留、滞拨等情况发生，对发现有资金使用率偏低、资金滞留较大的项目，督促项目主体单位落实整改、规范使用。阿克苏市安居富民工程是援疆项目中最大的交支票工程，三年来投入援疆资金1.538亿元，帮助当地农牧民改造危旧房1.538万户。指挥部对此实行资金使用函告制度，对该项目的资金使用进行了特殊监管。援疆资金拨付至阿克苏市财政局安居富民项目专项资金账户后，阿克苏市安居富民办在具体拨付和使用资金时必须函告指挥部，书面报告资金的拨付时间及拨付额度，使指挥部及时掌握该项目资金的使用动态，保证每户一万元援疆补助资金能及时足额的发放到农牧民手中，发挥援疆资金“四两拨千斤”的作用。
三是实行援疆项目审计函询制度，强化结果监督。2015年7月指挥部内审小组在对当地某局实施的产业工人培训项目审计时，发现组织培训的负责人、选择的培训学校等内容，与阿克苏市纪委常委会谈论处理该局前几年组织培训项目存在违纪问题相同，阿克苏市纪委根据举报查实该培训机构存在虚报冒领培训费、拟处理该局培训负责人，由此，内审小组提出了对该援疆项目资金使用的存疑问题。指挥部决定用函询的办法，督促组织实施该项目的某局进行自查，并要求限期将结果报送指挥部。该局在规定的时间内出具了调查报告和培训项目负责人的说明材料，对培训学校作出了取消在阿克苏市承接培训业务的资格，该局负责同志表示，多年来局里组织各类人员培训，收到要求自查函询尚属首次，对指挥部认真严谨的作风给予赞许。近三年来，指挥部通过函询方式，督促当地项目实施单位整改了援疆资金开支不合理、未按规定程序采购、有预算未实施等问题，保证了援疆资金发挥应有效益。指挥部内审函询制度建立与实施，督促了当地项目实施主体单位加强内部监管，规范工作程序，为确保援疆资金安全起到了积极作用。
