杭州湾大桥设计有南北两个通航孔，分别可以满足3000吨和3.5万吨轮船通行。在航道上还建设有船舶交通管理系统，借助浮标、灯器以及雷达、高频通信系统，实时掌控大桥周边的船舶航行动态，保证船舶按规定航线航行。

　　值得关注的是，由于大桥的桥墩都是钢管桩，而且打的都是斜桩，相对更加牢固，不可能发生像九江大桥那样的事故。