1987年底两岸同胞隔绝状态被打破，面对两岸交往中衍生的具体问题，台湾当局不得不调整“不接触、不妥协、不谈判”的“三不政策”，1990年推动成立海峡交流基金会，就事务性问题与祖国大陆方面进行接触商谈。海基会首任董事长是辜振甫。

　　鉴于台湾当局的有关文件中明确表示坚持一个中国原则、追求国家统一,鉴于海基会以“中国的、善意的、服务的”为建会宗旨，祖国大陆方面为促进两岸交流、维护两岸同胞的正当权益、改善和发展两岸关系，同意进行事务性商谈，并于1991年12月16日成立海峡两岸关系协会。海协会会长为汪道涵。

　　1992年1月8日，成立不久的大陆海协致函邀请台湾海基会董事长、副董事长、秘书长率团来访。8月4日，汪道涵会长再次向辜振甫先生发出邀请，希望“就当前经济发展、两会会务问题，交换意见，治商方案”。8月22日，辜振甫正式回函接受邀请。 1992年11月，海协与海基会双方就在事务性会谈中各自以口头方式表述“海峡两岸均坚持一个中国原则”达成共识。

　　1993年4月8日至11日，台湾海基会副董事长兼秘书长邱进益访问北京，海协与海基会举行了汪辜会谈预备性磋商，确定了汪辜会谈的相关议题。

　　1993年4月27日至29日，台湾海峡两岸授权民间团体的最高领导人汪道涵和辜振甫，在新加坡举行了首次会谈，并郑重地在《汪辜会谈共同协议》等4份文件上签字，包括《汪辜会谈共同协议》、《两会联系与会谈制度协议》、《两岸公证书使用查证协议》和《两岸挂号函件查询、补偿事宜协议》。

　　《汪辜会谈共同协议》于1993年5月30日生效后，海协与海基会开始就两岸交流衍生的四个方面的问题进行事务性商谈。但由于台湾当局试图在两会事务性商谈中达到凸显“两岸分裂分治”的政治目的，致使事务性商谈历经17次却仍一事无成。1995年因李登辉访美破坏两岸关系，两岸事务性商谈被迫中断。

　　1998年10月14日，海基会董事长辜振甫率领海基会参访团前来祖国大陆进行为期6天的参访活动。时任中共中央总书记、国家主席的江泽民在北京礼节性地会见了辜振甫夫妇。10月15日，辜振甫与海协会长汪道涵经过两次会面并无拘束地交换意见后，双方达成了包括进行政治、经济对话及邀请汪道涵会长访问台湾等四项共识。

　　1999年7月，李登辉抛出“两国论”，破坏了两岸两会对话与交往的基础。